Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFMBT1Q9UHJ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms