Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLN8Q9UBY8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms