Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXTL2Q9UBQ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms