Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RRBP1Q9P2E9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms