Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL20A1Q9P218 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms