Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms