Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMG20BQ9P0W2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms