Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
ARHGEF12Q9NZN5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms