Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP1Q9NZI2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP1Q9NZI2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms