Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms