Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN2AIPQ9NXV6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms