Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms