Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPTLC3Q9NUV7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTLC3Q9NUV7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms