Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMSN1Q9NSI8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMSN1Q9NSI8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms