Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms