Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BIN3Q9NQY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BIN3Q9NQY0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms