Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRDM5Q9NQX1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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