Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms