Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms