Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUFT1Q9NNX1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUFT1Q9NNX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms