Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBEC3GQ9HC16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBEC3GQ9HC16 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms