Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LY9Q9HBG7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LY9Q9HBG7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms