Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6AQ9H2E6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms