Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF3Q9H094 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms