Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J8

WDR33, pre-mRNA 3' end processing protein WDR33, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR33Q9C0J8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR33Q9C0J8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR33Q9C0J8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR33Q9C0J8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR33Q9C0J8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR33Q9C0J8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR33Q9C0J8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms