Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms