Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms