Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FOXQ1Q9C009 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FOXQ1Q9C009 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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FOXQ1Q9C009 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FOXQ1Q9C009 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FOXQ1Q9C009 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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FOXQ1Q9C009 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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