Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BARHL1Q9BZE3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BARHL1Q9BZE3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms