Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms