Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms