Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KATNB1Q9BVA0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms