Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAF4Q9BUZ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms