Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM43Q9BTV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM43Q9BTV4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms