Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C16orf70Q9BSU1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms