Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG101Q9BSB4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG101Q9BSB4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms