Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms