Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CPPED1Q9BRF8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms