Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNS3Q9BQ31 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms