Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOPXQ9BPY8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms