Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPS6KC1Q96S38 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms