Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMKK2Q96RR4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms