Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARXQ96QS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARXQ96QS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms