Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms