Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms