Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C9orf85Q96MD7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms