Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF4Q96M43 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF4Q96M43 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms