Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00479Q96M42 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00479Q96M42 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms