Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS2Q96L46 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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