Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDLIM2Q96JY6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms